经中华人民共和国国务院办公厅批准，曲阜孔于研究院于孔子2547年诞辰纪念日一1996年9月28日举行了奠基仪式。
孔子是中国古代伟大的思想家。政治家和教育家，也是伟大的世界文化名人。孔子创立的儒学，曾对中国乃至整个东方世界过去二千多年的历史产生过巨大的影响，对当今世界和现代化的发展也潜发着越来越引人瞩目的作用。
孔子研究院的园林设计取意于古代“书院”，“它们多立于山林之中，有山有水，环境优美，设计中在建筑群的西北部堆山，象征“尼山”，上立“仰止亭”喻“高山仰止”之念：东北部挖池理水，象征“洙泗”，取《论语·雍也》“知者乐山，仁者乐水”之意，南面小沂河对岸堆土植树，喻“案山”，上设对景建筑喻“杏坛”。园林精心设计。种值苍松翠柏及观赏花木。
孔子研究院是城市、建筑、园林、以及绘画、书法、雕塑、工艺美术小品的有机结合：是既表现建筑美，又体现自然美；既体现高度的艺术文化内涵，又表现鲜明的时代精神和地方特色的融合的整体环境，它在一种肃穆庄严的“圣地感”的氛围中散发着亲切宜人、祥和的生活气息。
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