新疆昌吉回鹘寺是目前北疆地区仅存的回鹘寺庙遗址，规模宏伟，风格独特。寺庙座北朝南，南北长７０.５米，东西宽４３.８米，共有１５个洞龛、８座配殿、４座库房、５座僧舍，组成一个四合院落。正殿残高１４.３米，配殿残高０.２－４米不等。北面正殿两侧排列着上下两层佛洞。东西配殿尚存许多佛塑，内中佛祖、菩萨、罗汉、天王、神狮依稀可辩，其中有一卧佛，长达９米，为佛祖涅像，形象逼真、栩栩如生。卧佛对面存有一幅壁画，画工精细，色彩鲜艳，上书回鹘文字，清晰可见。西配殿内的佛塑或坐或站，情态各异。反映出当时佛教文化的发达程度。
回鹘寺的壁画，堪称一绝，大都以淡黑起稿，浓墨或土红定线。线条以素描为主，敷色多素雅平淡。以黄、红、赭等主色，技法熟练，构思独特，不失为古代艺术珍品。目前回鹘寺已被自治区列为重点文物保护单位。每年都引来大批考古工作者和游客，成为新疆闻名的旅游景点。
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